Melekler Evi, savaş muhabiri Ahmet'in Bosna'da yaralandıktan sonra yurda dönmüş olmasıyla başlar. Ahmet, kişisel sergi için terk edilmiş evlerin fotoğraflarını çekmek üzere Şanlıurfa'ya gelir. Üniversiteden arkadaş olan İbrahim'e uğradıktan sonra şehirde gezerek Harran'daki bir Kervansaray kalıntısında işlenen bir olayla karşılaşıyor.
Film, bu iki kişinin birbirine aşık olmasıyla oluşan umutsuz serüvenini anlatıyor.